Randy Pausch Last Lecture: Achieving Your Childhood Dreams

**********************************************************************
For people just looking for video’s, powerpoints or transcripts of Randy’s presentation(s), the most important links are these:

http://download.srv.cs.cmu.edu/~pausch/ Randy Pausch’s Web Site on Carnegie Mellon University, i.e. with links to transcripts and powerpoint-presentation (low resolution, used in this post) of his lectures.

http://www.cs.virginia.edu/~robins/Randy/ ” The Legacy of Randy Pausch” Dr. Gabriel Robins, colleague Professor, mentor and friend. With additional interesting links
http://www.cmu.edu/randyslecture/ about Randy Pausch’s Last Lecture
http://www.alice.org/ link to Alice
the video’s are shown below,

***********************************************************************

The other day I wrote about Twitter as an alternative and sometimes breaking news source.

That same day this news reached me via twitterer @Mndoci (Deepak Singh):

Randy Pausch. I didn’t know who that was, so I googled him.

There is a full record in Wikipedia, which is VERY up to date: Randolph Frederick Pausch (October 23, 1960 – July 25, 2008) was an American professor of computer science, human computer interaction and design at Carnegie Mellon University (CMU) in Pittsburgh..and a bestselling author who achieved worldwide fame for his The Last Lecture” speech on September 18, 2007 at Carnegie Mellon.

His “Last Lecture” was viewed online by over six million people and has been recently been published as a book (see Librarything description).

When he held the speech, he knew he had just a few months to live: the pancreatic cancer he was diagnosed with a year before had spread to other organs. He decided not to play it very emotional, but to go for dark humor.

This is how he starts his Last Lecture (which ironically had recently been renamed as ‘Journeys’). It sets the tone for the rest of the presentation:

“What Indira didn’t tell you is that this lecture series used to be called the Last Lecture. If you had one last lecture to give before you died, what would it be? I thought, damn, I finally nailed the venue and they renamed it. [laughter] So, you know, in case there’s anybody who wandered in and doesn’t know the back story, my dad always taught me that when there’s an elephant in the room, introduce them. If you look at my CAT scans, there are approximately 10 tumors in my liver, and the doctors told me 3-6 months of good health left. That was a month ago, so you can do the math. … We can’t change it, and we just have to decide how we’re going to respond to that. We cannot change the cards we are dealt, just how we play the hand. If I don’t seem as depressed or morose as I should be, sorry to disappoint you. [laughter] And I assure you I am not in denial. It’s not like I’m not aware of what’s going on….”

He ends the lecture entitled “Really Achieving Your Childhood Dreams” like this:

So today’s talk was about my childhood dreams, enabling the dreams of others, and some lessons learned. But did you figure out the head fake? [dramatic pause] It’s not about how to achieve your dreams. It’s about how to lead your life. If you lead your life the right way, the karma will take care of itself. The dreams will come to you. Have you figured out the second head fake? The talk’s not for you, it’s for my kids. Thank you all,good night

I found his speech very inspiring. A mixture of amusing stories and wise life lessons. Not just theories but real examples illustrating his points. Very clear and recognizable. His main theme: Brick walls are there for a reason: they let us prove how badly we want things. He showed how most of his dreams were realized (or dealt with or ‘adapted’: ‘Being Captain Kirk’ was changed in ‘Meeting Captain Kirk’), the magic word being perseverance: “never give up!”. Other one-liners: “Loyalty is a two way street”. “Give people enough time and they will always impress you”.

He learned a lot from other people. This is what he learned from his football coach when he was 9 years old:

“And he showed up for practice the first day, and you know, there’s big hulking guy, we were all scared to death of him. And he hadn’t brought any footballs. How are we going to have practice without any footballs? And one of the other kids said, excuse me coach, but there’s no football. And Coach Graham said, right, how many men are on a football field at a time? Eleven on a team, twenty-two. Coach Graham said, all right, and how many people are touching the football at any given time? One of them. And he said, right, so we’re going to work on what those other twenty-one guys are doing. And that’s a really good story because it’s all about fundamentals. Fundamentals, fundamentals, fundamentals. You’ve got to get the fundamentals down because otherwise the fancy stuff isn’t going to work.”

He also stresses that it’s not what you say but how you say it (“c’est le ton qui fait la musique”). Here he tells a story about how his dutch uncle and first boss Andy ‘beats him up’.

“He Dutch-uncled me. And he put his arm around my shoulders and we went for a little walk and he said, Randy, it’s such a shame that people perceive you as so arrogant. Because it’s going to limit what you’re going to be able to accomplish in life. What a hell of a way to word “you’re being a jerk.” [laughter] Right? He doesn’t say you’re a jerk…”

The same uncle stimulated him to do his PhD instead of taking a job:

“It wasn’t the kind of thing people from my family did. We got, say, what do you call them? …. jobs. And Andy said, no, don’t go do that. Go get a Ph.D. Become a professor. And I said, why? And he said, because you’re such a good salesman that any company that gets you is going to use you as a salesman. And you might as well be selling something worthwhile like education.[long pause, looks directly at Andy van Dam] Thanks.”

He did do his PhD and became a charming professor, a brilliant researcher ànd a gifted teacher. His specialty was virtual reality. He was able to mix theorie and practice in a very fruitful way. For instance he combined his work as a professor of Computer Science, Human-Computer Interaction, and Design at Carnegie Mellon with Sabbaticals at Walt Disney Imagineering and Electronic Arts (EA) (one of his childhood dreams) and he became co-founder of Carnegie Mellon’s Entertainment Technology Center (ETC). He also was the director of the Alice (www.alice.org), a software project ‘learning’ children to program while they just think they’re making movies and video games. The good stuff is coming in the next version, where we will teach them Java language while they think they are writing moviescripts using Sims characters, Randy said.

“I, like Moses, get to see the promised land, but I won’t getto set foot in it. And that’s OK, because I can see it. And the vision is clear. Millions of kids having fun while learning something hard. That’s pretty cool. I can deal with that as a legacy.”

And what a legacy this is. Randy’s wife, Jai, put out a statement the day he died thanking “the millions of people who have offered their love, prayers and support. Randy was so happy and proud that the lecture and book inspired parents to revisit their priorities, particularly their relationships with their children,” she said. “The outpouring of cards and e-mails really sustained him.” (Foxnews, July 28th)

Please enjoy the videos and/or go to links below where you can find more information.

more about “Randy Pausch Last Lecture: Achieving …“, posted with vodpod

Apart from his last lecture I also include his lecture on time management. This was something Randy also was an expert in. I’m sure it will be very inspiring as well.

more about ““Time Management” by Randy Pausch, No…“, posted with vodpod

Miscelanous Sources (other than referred to above)

http://en.wikipedia.org/wiki/Randy_Pausch
interview with oprah – 2007 (slideshow- oprahshow)
Time special: Randy Pausch on the fifth annual list of the world’s most influential people
Foxnews, July 28th

————————————————————–

Eerder schreef ik dat Twitter soms een heel goede en snelle nieuwsbron kan zijn.

Diezelfde dag las ik de volgende twitter van @Mndoci:

Randy Pausch. Ik had eerlijk gezegd geen idee wie het was, dus heb even gegoogled.

Er is een volledige pagina in Wikipedia, over Pausch, die nogal erg up to date was: Randolph Frederick Pausch (October 23, 1960 – July 25, 2008) was an American professor of computer science, human computer interaction and design at Carnegie Mellon University (CMU) in Pittsburgh..and a bestselling author who achieved worldwide fame for his The Last Lecture” speech on September 18, 2007 at Carnegie Mellon.

Zijn “Laatste Lezing” werd zeker door meer dan 6 miljoen mensen bekeken en is recent als boek uitgebracht (zie Librarything).

Toen hij de toespraak hield had hij net te horen gekregen dat hij nog maar enkele maanden te leven had. De pancreaskanker (het jaar daarvoor bij hem vastgesteld) was uitgezaaid en niet meer behandelbaar. Hij had er heel emotioneel over kunnen doen, maar het lag meer in zijn aard om het met wat galgenhumor te brengen.

Ironisch genoeg was de naam ‘Last Lecture’ net gewijzigd in ‘Journeys’. De lezing heette de last lecture omdat je aan de studenten levenswijsheden zou onderwijzen alsof het de laatste mogelijkheid was: wat geef je mensen mee als je weet dat je nog maar kort te leven hebt? Maar nu was het letterlijk zo. Randy grapte meteen: nu ben ik eindelijk zover dat ik de lezing mag geven, veranderen ze de naam.

Zijn lezing heet “Really Achieving Your Childhood Dreams”. Hij vertelt hoe hij zijn kinderdromen heeft gerealiseerd of omgevormd (Captain Kirk zijn werd Captain Kirk ontmoeten, dat is gelukt). Sommige dromen die hij niet gerealiseerd heeft (premier league football player), hebben toch hun nut gehad omdat hij belangrijke zaken leerde, die hem later in zijn leven goed van pas zouden komen. Hij leerde bijvoorbeeld van zijn rugby-trainers hoe belangrijk het was te volharden: eerst de basis leggen, dan de vruchten plukken.

Zijn lezing gaat niet alleen erom hoe je je eigen dromen kunt verwezenlijken (of eigenlijk hoe je moet leven), maar ook hoe je die van anderen kunt verwezenlijken. Dat was zijn sterke punt.

Hij was van plan gewoon een baantje te nemen, zoals iedereen in zijn familie, maar op aanraden van een nederlandse oom ging hij studeren (computerwetenschappen), promoveerde hij en werd hij professor en nog belangrijker: een charmante persoonlijkheid, een briljante onderzoeker en een begenadigd leraar. Hij was gespecialiseerd in “virtual reality” en zag een van zijn kinderdromen (disney-imagineer) in vervulling gaan toen hij op vernuftige wijze zijn professoraat in Carnegie Mellon wist te combineren met (meerdere) Sabbaticals bij Walt Disney Imagineering and Electronic Arts (EA). Later zette hij zelf het Carnegie Mellon’s Entertainment Technology Center (ETC) op. Ook was hij directeur van Alice (www.alice.org), een software project dat kinderen ‘leert’ te programmeren, terwijl ze denken dat ze films en video’s maken. In de komende versie wordt kinderen geleerd met Java te werken terwijl ze denken dat ze scripts voor een film met Sims-figuren schrijven.

Het is een mooie nalatenschap, die Randy ons achterliet

“I, like Moses, get to see the promised land, but I won’t getto set foot in it. And that’s OK, because I can see it. And the vision is clear. Millions of kids having fun while learning something hard. That’s pretty cool. I can deal with that as a legacy.”

Voor details van zijn lezing verwijs ik verder graag naar de video’s, engelse citaten en verdere literatuurverwijzingen hierboven.

Simon’s Cat ‘TV Dinner’

Seen at the website of Francisco van Jole: A hungry cat.

Nice to see for those who love cats (most of the time)

more about “Simon’s Cat ‘TV Dinner’“, posted with vodpod

—-

Een hongerige kat.

Dit filmpje wil ik de kattenliefhebber (en hater?) niet onthouden. Tamelijk herkenbaar.

Twitter as a modern tam-tam

I´ve just discovered Twitter, a free social networking/microblogging service. As described in a previous post I prefer Twitter to Hyves: it’s globally oriented, more interactive and there are more collegues out there.

Via Twitter you can share ideas and thoughts with people with the same kind of interest (followers/-ing). People tell what they’re doing, give links to interesting information. Sometimes Twitter serves like an Q&A. It is only difficult to condense the message to 140 characters -and still be understood. Here is an example:

laikas Does anyone know the code(s) in PubMed for : ‘has been indexed’ and ‘has not been indexed’. There are so many papers unindexed >1 yr old. about 19 hours ago from web

eagledawg @laikas Not all citations will have MeSH [PubMed - indexed for MEDLINE], details on why (scope,author manuscripts) at http://snurl.com/34lyf

laikas @eagledawg Thnx. PubMedCentral® manuscripts may be the main culprit in this set.
about 2 hours ago from web in reply to eagledawg

eagledawg @laikas yep that will do it too! Hard to explain anything about NLM resources in only 140 characters about 2 hours ago from twhirl in reply to laikas

Apart from being a social platform, Twitter can also function as a news breaking platform. In case of the China earthquakes, for instance, Twitter brought faster coverage than traditional media. (i.e. see this blog about technology from BBC News)

A Dutch example: the news that Joran van der Sloot (possibly involved in Natalee Holloway’s disappearance) threw a glass of red wine in the face of private detective Peter R. de Vries after a TV broadcast first appeared on Twitter. Corrie Gerritsma saw it all happen in the studio, twittered it, which was picked up by Fransisco van Jole, a journalist, specialized in Internet coverage (see his post here). While the official media were asleep, Francisco made it public on Twitter. Later a video showing the incident appeared on You Tube. I learned these facts from yet another twit: dutchcowboys. Thus Twitter is really working as a tam-tam here. Dutchcowboys notes that although the group twitterati is small they’re moving closer and closer to the fire.

Quite coincidentally I picked up two very different news stories simultaneously through Twitter yesterday morning while at work.

One was about the Bomb blasts in Bangalore, brought to us via Twitter by @mukund and @narain (via @pfanderson). They covered in detail what happened, before the official news releases.

Mukund twittered:

6 minutes ago: Bomb Blasts in Bangalore – 4 locations, details to follow #Bloreblast
4 minutes ago: Blasts at: Sirjapur Road, Nayandhalli, Madiwala , Adugodi, Rajaram and Mohan Rai Circle
1 minute ago: Bangalore blasts – telecom connectivity is broken so trying to call bangalore wont work

And finally blogged about it (see post here). The usefulness of Twitter to follow the events was stressed by Daniel Bennett at his post: using Twitter to follow the bangalore bomb blasts (click here). Daniel is a PhD student researching the impact of blogging and new media on the BBC’s coverage of war and terrorism.

Although the news is not verified and authorized, it is fast, and that may be important, especially for local news (also to reassure people: ‘no death’). Other examples and thoughts about Twitter’s relevance as a news source see the comments to the post on ‘BBC news technology’ I referred to before.

The other event I was alerted to at the very same moment was local news from the ‘University of Leicester (UoL) Library (UK), where the falling down of a part of the heavy wooden ceiling in the new library caused a little disaster (luckily without any casualties), resulting in a temporary closing. Interestingly, Leicester Twitter-users were well aware of the event before it was common knowledge, and colleagues were informing each other via Twitter. The question then asked, both at the blog of the Leicester Library and on 2 video’s by @AJCann (one below): how should we respond to such unofficial events (possibly much worse events at a crowded campus)? And which role social media have to play in such a context?

more about “Vodpod Firefox Extension for WordPress”, posted with vodpod
http://api.seesmic.com/#/video/iae6d6VuZW/watch

In a second video (made that same day) AJCann stressed that:

“everything with a service function should have a service dashboard especially in case of services outages, like Twitter.com and wordpress.com have.
Where is your university organization service dashboard? How does your organization inform about the status of your institution, library, blog, lecture, module, whatever?”
(freely cited)

On his video he referred to the url http://tinyurl.com/6h42hs: the announcement on “Movius Interactive Corporation Announces Rapid Alert Application” on O’Reilly Radar.

Certainly, also a service like PubMed should be in dashboard to notify their customers of outages. As Michelle Kraft recently ranted at her blog (see her post here):

Apparently PubMed’s servers went down at 1:00am that morning… As usual the emails started coming in from Medlib-l regarding PubMed. Librarians from different areas of the United States asking about the health status of PubMed as they too noticed it doing funky things. There was a brief discussion and some questions raised on Twitter Medlibs about what to do if PubMed goes down and you don’t have access to Ovid. What do you do, where do you send patrons? Would third party tools work?

Thus again the unofficial tam-tam did its job, but wouldn’t it be far better if PubMed itself “put an obvious note on the site when there is an outage or if there are problems”?

Indeed Web 2.0 communication is an undeveloped area. There are plenty possibilities, not only for individuals, but also for libraries, hospitals, universities and organizations.
But how to convince the majority of people that think those tools/sites are just trendy?!

Note added ‘in proof’: while I was working on this post, @mukund was twittering about new blasts in Ahmedabad.

———————–

Ik ken de gratis netwerk/microblogging dienst Twitter eigenlijk nog maar kort, maar ben er nu al enthousiast over. Zoals ik eerder schreef verkies ik Twitter boven zo’n site als Hyves, dat meer een profielensite is, minder interactief èn Nederlandstalig. Met Twitter bereik je veel meer mensen, ook (en in mijn geval vooral) veel collega’s.

Via Twitter kun je ideeen en gedachten met geestverwanten (followers/-ing) delen. Mensen vertellen wat ze aan het doen zijn, of geven links naar interessante informatie. Soms is Twitter net een vraagbaak (Q&A). Alleen is het soms een hele kunst om je boodschap helder over te brengen in 140 tekens, zoals wel blijkt uit de volgende, overigens zeer nuttige, conversatie:

laikas Does anyone know the code(s) in PubMed for : ‘has been indexed’ and ‘has not been indexed’. There are so many papers unindexed >1 yr old. about 19 hours ago from web

eagledawg @laikas Not all citations will have MeSH [PubMed - indexed for MEDLINE], details on why (scope,author manuscripts) at http://snurl.com/34lyf

laikas @eagledawg Thnx. PubMedCentral® manuscripts may be the main culprit in this set.
about 2 hours ago from web in reply to eagledawg

eagledawg @laikas yep that will do it too! Hard to explain anything about NLM resources in only 140 characters about 2 hours ago from twhirl in reply to laikas

Twitter is echter niet alleen een sociaal medium, maar zorgde meerdere malen voor een primeur, zoals bijvoorbeeld over de aardbevingen in China. Twitter bracht het nieuws sneller dan de traditionele media (zie bijvoorbeeld dit blog over technologie van BBC News)

Om dichter bij huis te blijven: het ‘nieuws’ dat Joran van der Sloot (die mogelijk betrokken is bij de verdwijning van Natalee Holloway) na een tv-uitzending een glas rode wijn in het gezicht van Peter R. de Vries had gegooid, werd het eerst bekendgemaakt via Twitter. Corrie Gerritsma zag het incident, plaatste een bericht op Twitter, dat opgepakt werd door de journalist Fransisco van Jole (zie bericht). Terwijl de Telegraaf ’sliep’, bracht Francisco deze primeur naar buiten via Twitter en later via zijn blog. Daarna verscheen er ook nog een You-tube video van het hele gebeuren. Op mijn beurt las ik dit alles weer op een twit van de dutchcowboys. Dus Twitter werkt soms echt als een tam-tam. Dutchcowboys merkt ook op:

“Twitter lijkt ondanks de nog relatief kleine groep van gebruikers steeds dichter op de actualiteit te kruipen“.

Heel toevallig kwamen gisteren via Twitter 2 heel verschillende nieuwsberichten voorbij.

Een ging over bomaanslagen in Bangalore, via de Twitterati @mukund and @narain wereldkundig gemaakt (getipt door @pfanderson). Vòòrdat de officiele kanalen het raporteerden.

Minuut na minuut twitterde Mukund:

Bomb Blasts in Bangalore – 4 locations, details to follow #Bloreblast
Blasts at: Sirjapur Road, Nayandhalli, Madiwala , Adugodi, Rajaram and Mohan Rai Circle
Bangalore blasts – telecom connectivity is broken so trying to call bangalore wont work

Vervolgens vond hij ook nog tijd om erover te bloggen (zie hier). Het belang van Twitter in dit opzicht werd uit de doeken gedaan door Daniel Bennett: using Twitter to follow the bangalore bomb blasts (zie hier). Als promovendus onderzoekt Daniel de effecten van web 2.0 media op de oorlogsverslaggeving door de BBC.

Hoewel niet officieel en niet geverifieerd, is het nieuws er wel heel snel. Met name bij locaal nieuws kan dat van belang zijn, niet alleen om mensen te waarschuwen, maar ook om ze gerust te stellen (‘geen doden‘). Zie voor enkele andere voorbeelden van het belang van Twitter als nieuwsbron, de commentaren op het BBC news technologie-blogbericht.

Vrijwel tegelijkertijd speelde zich een klein drama in de ‘University of Leicester (UoL)’ Bibliotheek af: een deel van het zware plafond van het net nieuwe gebouw was naar beneden gevallen. Gelukkig was dit vòòr openingstijd gebeurd en waren er geen slachtoffers, maar de bibliotheek werd wel tot nader order gesloten. Werknemers met een twitter-account hoorden het nieuws het eerst. Continu stelden ze elkaar op de hoogte via Twitter, ook toen er rond het middaguur weer groen licht gegeven werd.
De twitteraar @AJCann stelde zich toen de vraag hoe we op dergelijke onofficiele berichten horen te reageren en welke rol de sociale media in deze context moeten spelen. Zie de discussie op het blog van de U0L Bibliotheek. Ook maakte hij diezelfde dag nog 2 video’s, waaronder bovenstaande video.

In een 2e video benadrukte AJCann:

“everything with a service function should have a service dashboard like Twitter.com and wordpress.com have, especially in case of services outages,
Where is your university organization service dashboard? How does your organization inform about the status of your institution, library, blog, lecture, module, whatever?”
(vrij ‘vertaald’)’

Op de video is steeds de url http://tinyurl.com/6h42hs: in beeld een verwijzing naar een bericht op O’Reilly Radar over de noodzaak van een snel waarschuwingssysteem.

Zo’n waarschuwingsysteem zou ook een dienst als PubMed niet misstaan om de gebruikers te waarschuwen als ze weer eens ‘down’ zijn, of hun servers overbelast. Ik moest hieraan denken, omdat Michelle Kraft het kortgeleden hierover had (zie hier voor haar blogbericht):

Apparently PubMed’s servers went down at 1:00am that morning… As usual the emails started coming in from Medlib-l regarding PubMed. Librarians from different areas of the United States asking about the health status of PubMed as they too noticed it doing funky things. There was a brief discussion and some questions raised on Twitter Medlibs about what to do if PubMed goes down and you don’t have access to Ovid. What do you do, where do you send patrons? Would third party tools work?

Dus wederom is het zo dat de onofficiele tamtam zijn werk deed (voor diegenen die het volgden), maar het zou toch veel beter zijn als PubMed problemen zelf officieel aankondigde.

Web 2.0 communication is een nog onontgonnen gebied. Het biedt heel veel mogelijkheden, niet alleen voor individuen, maar ook voor bibliotheken, universiteiten, ziekenhuizen, organisaties.
Maar dan is het wel nodig dat de grote meerderheid die denkt dat het allemaal maar niets is of veel te trendy over de streep getrokken wordt… net als ik, een paar maanden geleden.

PubMed Search Clinic on ATM, Citation Sensor, Advanced Search: Video available.

The video from the online Search clinic on recent PubMed changes, announced in a previous post is now available at: nlm.nih.gov (pmupdate08): click here.

Direct link to the video only: https://webmeeting.nih.gov/p91519064/

A good coverage is given by Michelle Kraft (Krafty Librarian) at her site (click here).

The clinic, presented by Katherine Majewski, updated recent changes to PubMed, earlier described at the NLM information bulletins on the new ATM and the Beta Advanced Search page.
Recent changes have also been amply described (and discussed) at several of my previous posts, most notably this one.

Here is an overview, with emphasis on new aspects (at least to me).

Citation Sensor:

In the clinic the citation sensor was defined as: “a new feature designed for users seeking specific citations”. However it is not a separate search box. The citation sensor works automatically when you type words into the general search bar. If combination of words are recognized as representing citations (e.g. volume numbers, author names, journal titles) the matches are displayed in a yellow box above the retrieval.

In my previous post I already discussed that the sensor doesn’t always work perfectly and like Krafty, I think that the Single Citation Matcher (in the blue side bar) performs better. It suggests author and journal titles as you write them. Furthermore, you can just fill in the specific information you know in specific fields, i.e. if the author name is misspelled/wrong, it often suffices to fill in year, page number and title word(s), to name just one possible combination. In response to a question, Majewski said the sensor is not an advantage per se as opposed to the Single Citation Matcher. Probably it is just handy for people used to a Google-like way of searching.

One thing new to me was that there are two “Details” when performing a search.

When you type: choi blood 2008, the citation sensor finds 6 hits, 3 of them shown in the yellow box.
The Details button shows: choi[All Fields] AND (“blood”[Subheading] OR “blood”[All Fields] OR “blood”[MeSH Terms]) AND 2008[All Fields].

However when you click 6 articles to see them all, the Details button shows how the citation sensor has translated the search in: choi[Author] AND (blood[Author] OR “Blood”[Journal]) AND 2008[Publication Date]

Thus in fact the search is translated twice (although the citation sensor-results are always a subset of the full results). If you click on 6 articles, the 2nd translation appears as a 2nd search in the Search History.

ATM – Automatic Term Mapping.

ATM has been changed in conjunction with the citation sensor in order to identify queries that contain citation-type information. The old ATM mapped search terms to subject, journal, and author tables in that order. If a MeSH-match was found, PubMed would search for that MeSH as well the user-input as a textword (title, abstract). Automatic term mapping would then stop because it found a match with MeSH. Thus terms that are not only in the MeSH but also in the author or journal table would have been missed, such as in Burns Laryngoscope 2005. The old ATM would map Burns and Laryngoscope as MeSH (subject-search), but the new ATM also searches these terms in ‘all fields’, thus enabling the retrieval of the paper of Burns in Laryngoscope.
In the Q & A part of the session Majewski advised to use qualifiers as MeSH when Burns is searched just as a topic. I only wonder if/how most of the untrained people would find this out.

Another consequence, not really addressed here, is that multi-term words are split and searched individually. With the new ATM, gene therapy is not only searched as the phrase gene therapy (as MeSH-term and textword) but also as ”gene”[All Fields] AND “therapy”[All Fields], which leads to a far greater retrieval (almost 250%). Few of these extra hits are relevant. (see previous post)

Statistics, however, show that the thousands (‘real’) queries performed returned only 10% extra hits on average (see ATM-FAQ for more information). According to NLM, the enhanced ATM and citation sensor have considerably improved searching PubMed. Probably because most people just come to PubMed to search a specific paper or subject (running one or two search commands). The new features enhance citation searches, while subject searches do not suffer too much as long as multiple terms (concepts) are used, as this will filter much of the noise seen with one term (because the term is searched within the context of the other word).

My remark that most of my patrons do do subject searches was interpreted as “do do broad searches“. Which in effect they do (i.e. searches for systematic reviews), but I do not think the suggested NCBI books might be very helpful to them, although it might indeed serve those people (patients?) that want information about broad subjects like “burns”. Perhaps PubMed/NCBI can offer subject searchers other tools as well.

Notably, based on user input there are now (as of July 2nd) some exceptions to the new ATM-rule:
Substance names (such as ferrous glucanate) and MeSH with stand alone letters or numbers (like complement factor B) will not be broken apart, but searched as a phrase.

Advanced Search (Beta-version)
Advanced Search is amply discussed in a previous post. However, I didn’t mention that the page consists of 4 collapsible boxes beneath the Search Bar (I missed this: you have to click a small minus sign at the upper left of each box in order to collapse.) In essence you can search by many fields, the default fields displayed being Author, Journal, and Publication Date (box2) and all fields (box 4). There is an index for each selected field available (little buttons right of the search boxes). I see no other difference between box 2 and 4 than the defaulted field and the fact that you can only make multiple choices from the index in box 4. Answering a question in the audience Majewski said they might consider allowing multiple choices in box 2 as well.
Box 3 shows limit-options, much the same as the Limit-tab in the usual frontpage, except that you can unlock your limits to future searches using the lock icon (by defaulted limits are carried to future searches).

Thus again this new ‘enhancement’ mainly facilitates citation searches, not subject searches. Clinical Queries are absent and it is for instance not possible to look up any MeSH other than by index, and even this often goes wrong with multi-word terms. The question why MeSH-trees were unavailable in the beta-version remained unanswered at the clinic.
It was a relief though to hear that there were no intentions to replace the normal PubMed frontpage by this advanced search page in due course.

Katherine Majewski ended the clinic by saying that answers to the questions posed during the clinic would be shown at this NLM-page later. She also encouraged to give positive and negative feecback by writing to the NLM customer service and to be as specific as possible if your search was negatively affected by the recent PubMed changes.

——————————-

De video van de PubMed Search Clinic, die ik in een eerder bericht aankondigde is nu te zien op: http://www.nlm.nih.gov/bsd/disted/clinics/pmupdate08.html.

Directe link naar de video: klik hier

Michelle Kraft (Krafty Librarian) heeft de clinic al goed op haar blog samengevat.

De webpresentatie, gegeven door Katherine Majewski, behandelde de recente PubMed-veranderingen, zoals aangekondigd in de NLM informatiebulletins (gewijzigde ATM-mapping resp. Beta Advanced Search)
Eerder heb ik deze veranderingen ook al uitgebreid beschreven en becommentarieerd. (zie bijv. hier).

Hier een samenvatting, met nadruk op nieuwe aspecten

Citation Sensor:

In de webpresentatie werd de “citation sensor” omschreven als: “a new feature designed for users seeking specific citations”. Het is echter geen aparte zoekoptie. De citation sensor doet zijn werk automatisch als je woorden in de algemene zoekbalk typt. De als citaties herkende hits worden apart op een gele achtergrond getoond.

Eerder heb ik al opgemerkt dat de sensor niet altijd goed werkt en evenals Krafty denk ik dat de Single Citation Matcher (in the blauwe balk) veel beter werkt. Deze geeft nl. woordsuggesties terwijl je typt en je kunt elke mogelijke informatie specifiek invullen. Weet je een auteur niet dan kun je vaak volstaan met jaar, paginanummer en titelwoorden, om maar één combinatie te noemen. Volgens Majewski is de sensor ook niet perse beter. Waarschijnlijk is het vooral handig voor mensen die gewend zijn aan een Google-zoekwijze en die verder weinig weten van PubMed. Zelf zou ik toch wel graag willen dat je de citation sensor naar believen aan of uit kon zetten.

Ik zag nu pas voor het eerst dat je 2 “Details” hebt, als de citatie-sensor iets mapt.

Typ je: choi blood 2008, dan vindt de sensor 6 hits en toont er 3.
Onder Details is te zien dat Pubmed de search vertaald als: choi[All Fields] AND (“blood”[Subheading] OR “blood”[All Fields] OR “blood”[MeSH Terms]) AND 2008[All Fields].

Als je op 6 articles klikt om ze allemaal te zien, staat onder Details hoe de citatie-sensor de search vertaald heeft: choi[Author] AND (blood[Author] OR “Blood”[Journal]) AND 2008[Publication Date]

Dus, er zijn eigenlijk 2 ‘vertaalslagen’ Als je op 6 articles klikt dan verschijnt de 2e mapping als een zoekset in the zoekgeschiedenis.

ATM – Automatic Term Mapping.

ATM is evenals de citatie-sensor ontwikkeld aangepast om zoekacties gericht op het vinden van artikelen te vergemakkelijken. De oude ATM stopte met het zoeken van termen in de MeSH-, auteurs- en tijdschriftenlijst als een passende MeSH was gevonden. Tevens werd het ingetypte woord als tekstwoord gezocht. Met als gevolg dat termen die zowel in de MeSH- als in de auteurs- of tijdschriftenlijst voorkwamen nooit anders dan als MeSH (en tekstwoord) werden gezocht. Met Burns Laryngoscope 2005 zou dus nooit het artikel van Burns in Laryngoscope zijn gevonden. Met de nieuwe ATM lukt dat wel.
Majewski adviseerde om veldenaanduidingen (qualifiers). zoals MeSH te gebruikenals je op een onder onderwerp zoals ‘Burns’ wilt zoeken. Dan vraag je je wel af in hoeverre de gemiddelde Pubmed -gebruiker dit weet.

Tijdens de sessie werd niet echt aangekaart dat termen die uit meerdere woorden bestaan worden opgesplitst en in alle velden worden gezocht. Eerder heb ik al laten zien dat bij de nieuwe ATM 2,5 x meer hits oplevert met een term als gen therapie en dat de meeste van deze hits weinig relevant zijn.

Volgens de NLM statistieken leiden echte zoekacties gemiddels slechts to 10% extra hits (zie ATM-FAQ voor meer info) en zijn zoekacties door de vernieuwingen aanzienlijk verbeterd . Waarschijnlijk omdat de meeste mensen alleen maar snel even iets opzoeken (1-2 zoekopdrachten) en vooral geinteresseerd zijn in specifieke artikelen. Wat dat levert het intypen van wat termen in de zoekbalk nu eerder wat op, en zolang je veel termen met elkaar combineert heb ik ook niet veel last van veel ruis bij het zoeken op onderwerp. Maar ik ben zeker niet overtuigd dat dit het zoeken op onderwerp verbetert.

Mijn opmerking dat mijn klanten vooral op onderwerp zoeken werd opgevat als dat ze vooral breed zoeken. Nu is dat wel zo, maar ik denk niet dat zij veel aan suggesties hebben als NCBI-books. Dit lijkt me wel geschikt voor mensen die zich globaal willen inlezen in een onderwerp als brandwonden (burns), patienten bijvoorbeeld. Misschien heeft PubMed/NCBI wel nog andere tools voor uitputtende searches in het verschiet….

Op basis van gebruikersfeedback zijn er vanaf 2 Juli wel enkele uitzonderingen op de nieuwe ATM-regel, t.w.:
Substance names (zoals ferrous glucanate) en MeSH with losstaande letters en cijfers worden niet langer opgesplitst, maar als phrase gezocht.

Advanced Search (Beta-versie)
Advanced Search heb ik ook eerder uitgebreid besproken (zie hier). Wat ik nu pas bemerk, is dat de velden onder de zoekregel in-en uitklapbaar zijn. Er is een miniscuul min tekentje helemaal linksboven elk veld, waar je op moet klikken om het veld te verkleinen.

De essentie van advanced search is dat je veel verschillende velden kunt doorzoeken, maar dat de standaard velden weer citatie-gericht zijn, dus: Author, Journal, and Publication Date (veld 2) en All Fields (veld 4). Je kunt termen voor elk gekozen veld opzoeken in een index (klein knopje rechts). Ik zie eigenlijk geen verschil tussen veld 2 en 4, behalve dan het standaard veld en het feit dat je in het 4e veld verschillende termen tegelijk kunt aanklikken. Mogelijk komt deze optie ook voor veld 2.
In veld 3 kun je limieten aanklikken, eigenlijk erg vergelijkbaar met de Limit-Tab op de PubMed openingspagina. Wel prettig dat je een limiet desgewenst alleen gedurende één zoekactie kunt toepassen (default: blijft alle zoekacties aanstaan).

Dus ook advanced search beta is vooral ten dienste van degene die bepaalde artikelen zoekt. Je kunt bijvoorbeeld alleen maar de MeSH in de index opzoeken en er zijn geen Clinical Queries. De vraag waarom De MeSH-hierarchie niet geraagdpleegd kon worden vanuit bleef onbeantwoord.
Het was wel een pak van mijn hart, dat het volgens Majewski niet de bedoeling was dat de Advanced Search de normale openingspagina op termijn zou vervangen.

Katherine Majewski beeindigde de sessie met de mededeling dat antwoorden op gestelde vragen later op deze pagina zou verschijnen.

Ze verzocht iedereen ook hun eventuele problemen met de veranderingen zo specifiek mogelijk aan de help desk door te geven.

PubMed Online Search Clinic on ATM!

Just a short note at the last moment.

Back from vacation I picked up some twitter and blog messages announcing a PubMed search clinic offered at July 17 (today!) at 2pm Eastern time (8pm Amsterdam/Paris time, see timetable throughout the world).

A 30 minute online search clinic will be presented by the NLM® and the National Training Center and Clearinghouse (NTCC) via Adobe® Connect^TM on Thursday, July 17th (2pm ET). The presentation will cover changes to PubMed including changes to how PubMed handles your search (the new automatic term mapping process), the citation sensor, and the beta Advanced Search page.

There is a maximum capacity of 300 participants, on a first come first served base. However, the clinic will be recorded and will be available for viewing later.

To follow the clinic log in at: https://webmeeting.nih.gov/pmupdate08/

or: http://www.nlm.nih.gov/bsd/disted/clinics/pmupdate08.html.
Here you find more info about the clinic, as well as tips for successful participation in the clinic. Be sure to test it beforehand.

Sources:

The Krafty Librarian: @Krafty (twitter) and several posts on her blog.

Nikki (Eagledawgs) guest post on David Rothman’s blog

Background info on what others have blogged about recent Pubmed can be found on another Krafty Librarian’s post and several of my previous post, including PubMed: Past, Present And Future, PART II

************************

Even op de valreep.

Net terug van vakantie zag ik enkele twitters en blogberichten die een “PubMed search clinic” aankondigden.

Deze begint om 8 hr p.m. (welke tijd waar?).

Het duurt 30 minuten en gaat over de recente veranderingen in Pubmed, de nieuwe ATM (automatic term mapping), de citation sensor en Advanced Search Beta.

Er kunnen 300 mensen deelnemen, volgens het “wie het eerst komt, het eerst maalt” principe. De clinic wordt wel opgenomen, zodat je hem later nog eens kunt bekijken.

Inloggen voor 19.00: https://webmeeting.nih.gov/pmupdate08/

Meer info op: http://www.nlm.nih.gov/bsd/disted/clinics/pmupdate08.html.
Inclusief tips om de clinic goed te kunnen volgen.

Bronnen:

The Krafty Librarian: @Krafty (twitter) en verschillende blogberichten.

Nikki (Eagledawgs) te gast op het blog van David Rothman.

Achtergrondinfo over wat anderen van de veranderingen vinden zijn ook te vinden de site van Krafty Librarian (zie hier). Enkele van mijn eerdere berichten zoals PubMed: Past, Present And Future, PART II zijn er ook aan gewijd.