Silly Saturday #22 – A Picture is Worth a 1000 Words.

17 04 2010

This post is my submission for the Grand Rounds to be hosted at Sterile Eye.
This upcoming edition has the theme VISUAL COMMUNICATION.

You know I love visualizations, they are so easy to understand.

No lengthy post here, because a picture is worth a 1000 words…..

—————————————

I

250lbs versus 120 lbs

The body scans side by side of 250 lb. woman versus 120 lb. woman.
Source: Bored Panda

Hattip: @EvidenceMatters, @rlbates & @streetanatomy who referred to a repost on LikeCool

———————————————————————–

II

Planes or Volcano?

We were wondering this today (April 16, 2010)

Source: Information is Beautiful

Hattip: Bitethedust & @mpesce “Turns out that a little volcanic action is surprisingly good for planet Earth They referred to a repost at The Daily Wh.at.

I’m a real fan of Information is Beautiful with its beautiful visualizations. See previous post on evidence for health supplements

———————————————-

III

Real Eyeballing

Source: Wolfram Demonstrations Project

Contributed to Sterile Eye 😉 : An interactive project showing hows the interaction between an eyeball and two of the muscles connected to it. Muscles deform as the eyeball rotates. You can download a live version.

Advertisements




Information is Beautiful. Visualizing the Evidence for Health Supplements.

21 03 2010

In a world driven by data, we need a simple means of digesting it all. Visualization of data may help to coop with the information overload. Good visualizations enable people to look at vast quantities of data quickly.

Bram Hengeveld at Geriatric Care (geriatricare.wordpress.com) told me of Snake Oil, a fantastic visualization of scientific evidence for popular health supplements. A well chosen name too, because Snake oil  is both a traditional Chinese medicine, as a  term for “medicines” that are fake, fraudulent, quackish, or ineffective. The expression is also applied metaphorically to any product with exaggerated marketing but questionable or unverifiable quality or benefit. (Wikipedia).

Snake oil is just one visualization at Information is Beautiful (link), the site created by David McCandless, a London-based author, writer and designer who wrote for The Guardian, Wired and others, and nowadays an independent data journalist and information designer. His passion: visualizing information – facts, data, ideas, subjects, issues, statistics, questions – all with the minimum of words (see about).

When you see snake oil you intuitively understand it all.

The image is a “balloon race”. The larger the bubble the higher its popularity in terms of number of Google hits. Orange bubbles look promising but have (yet) a low evidence.

The higher a bubble, the greater the evidence for its effectiveness. But the supplements are only effective for the conditions listed inside the bubble. Evidence is only shown for supplements, taken orally by an adult with a healthy diet.

Some supplements may be represented by multiple bubbles, one for each condition:  after all, the evidence may vary across conditions. For example, there’s strong evidence that Green Tea is good for cholesterol levels. But evidence for its anti-cancer effects is conflicting.

Another nice thing about Snake oil is that it is interactive. You can show (filter) the results for specific conditions or supplement types. Below I selected cardio. Most bubbles disappear. The evidence seems strong for green tea, fish oil and red yeast rice and low for vitamin E and omega-3. When you move your mouse over a bubble it pops up and you can read the supplements name and the condition to which the evidence applies.

Truly amazing.

One might ask how GOOD are the data on which these bubbles are based?

Well I haven’t checked, but the visualization generates itself from this Google Doc. The Google spread sheet shows all the data on which the visualization is based. These can be PubMed Records, Cochrane Systematic Reviews, Medline Plus or a full text paper. The image is automatically regenerated when the google doc is updated with new research that has come out.

The only thing that strikes me as a information specialists is that the way the evidence is retrieved is not stated. Probably this isn’t done in an evidence based way, because each piece of evidence is based on ONE article only. The choice of the paper seems rather random. And some supplements are rather vague. What is meant with “anti-oxidants?” Many of the supplements have anti-oxidant activity for instance.

But the idea in itself is great. Suppose we could gather the evidence in a more evidence based way, share it in Google Docs, appraise it and visualize it. Wouldn’t that be wonderful?





Visualization of Twitter Networks: Mailana

26 03 2009

Twitter is a free social messaging utility for staying connected in real-time. It has become my major social networking and information tool.

There are many Twitter Tools and API’s around. Many can be regarded as gadgets, nice to use, once, twice, thrice and ….then to forget. Some of the tools that I’ve bookmarked:

Some of these tools are just for fun, others (the last 3 for instance) tell you something about somebody’s twitter network or tweets.
In the last category a new tool has just been launched: Top Twitter Friends on http://twitter.mailana.com/. It is meant to answer the questions: Who do you talk to most often on Twitter? Who are your closest friends (BFF’s)? and What does your social network look like? But it gives also tips on who you should follow, how to find friends in your neighborhood (not successful in my hands) and to find a network of people talking about a certain topic.

optionsI like this tool very much, because it visualizes the network of your relevant contacts and their contacts. My present network looks like this:

laikas-network1

I’m automatically in the center. The thicker the threads with people, the more conversations you had with them. DM’s (direct messages) are excluded. When you pass your mouse over a portrait all rays starting from there color red. Within your network, other networks may be visible. For instance, in my network you see a “Dutch community” (wowter, gbierens, essen2punt0 etc) and an Australian one (@dreamingspires, @sandnsurf, bitethedust). Some people are pivots themselves: like @mikehawker and @scanman.
You can see anyone’s network by clicking a portrait or typing a name.

A list of your 10 closest “friends” is also shown. My closest “friend” is symtym, runners up are the librarians @pudliszek and @shamsha. And there is a list of 10 suggestions as well.

Finally you can make a map of conversations. The following map was created by searching for the hashtag #zorg20 (a dutch health 2.0 meeting). It will be no surprise that the organizer @zorg2.0 is almost in the center.

zorg-20

This tool looks really awesome.
However, it makes you realize that all your tweets and follows are charted. Can this be used to pick up people’s conversation at certain topics? Can it be misused?
I just wondered when I noticed that this system is driven by Mailana social network analysis system (see demo here). This system enables companies to find out valuable hidden information in company e-mails. As shown in the demo, you can search for a company name in Mailana and find which employees mail most about it. You even get a wordcloud on basis of which you can decide who gives you the most valuable information. It is easy to see how that can be used and misused in a company. Would you like your email to become searchable? I wouldn’t! Twitter is an open communication network, but still…..

In this respect it is interesting that according Danielle of the Health Informaticist:

….while the ‘laypeople’ are chattering away (…) a company called Salesforce.com has launched a product to allow “companies to search, monitor and join conversations taking place on Twitter directly in the Service Cloud.”(for more details see post here).

Gives me a bit uncomfortable feeling.

HATTIP: @drval (





Spoetnikblogs als een woordenwolk

9 08 2008

In een vorige post (zie hier) had ik het over WORDLE, een programma waarmee je woordenwolken kunt maken.

Het leek mij leuk om mijn Spoetnik-blogroll in een Wordle-creatie te vangen. Alle links die in mijn blogroll staan (stonden?!) bracht ik over naar Word en ik gaf gewicht aan de links door ze een aantal malen te kopieren, varierend van 1x tot 6x. De grootte van de woorden in Wordle is namelijk afhankelijk van hun frequentie. De woorden kun je in Wordle invoeren bij “create”. Wanneer de woordenwolk gecreeerd is kun je het aanpassen: lettertype, kleurenpalet en orientatie. Vervolgens kun je het in de galerij opslaan en printen, maar niet als figuur downloaden. Het is nl. gebaseerd op Java-script. Ik doe dat indirect via een programmaatje dat ik gekocht heb: SnagIt.

Vervolgens leek het me leuk alle spoetnikblogs in een echte wolk te vatten. Ik heb wel de http’s en wordpress etc. termen erafgehaald. In eerste instantie had ik het niet aangepast aan mijn blogrollversie, met als gevolg dat iemand onder 2 namen kon voorkomen oefenings~40’s~blog of oefening40. Vervolgens heb ik alleen de officiele spoetniknamen (webadressen) aangehouden. Alle blogs die geen belletje bij me deden rinkelen noteerde ik 1x, blogs die dat wel deden 2x en blogs die op mijn blogroll voorkwamen minimaal 3x. “Opgeheven” heb ik maar laten staan en blogs waarvan ik weet dat ze onder een andere naam gehandhaafd zijn heb ik ook vermeld: Een Beetje Adjunct (http://zeemanspraat.wordpress.com/ van Ubabert) en FNWI nieuwbouw beta bibliotheek (http://betabieb.wordpress.com/ van Zygomorf). Vanzelfsprekend is het gewicht dat ik eraan toegekend heb geheel persoonlijk.

Wordle is vooral fraai, het maakt woordwolken, blogrolls, tagsclouds e.d. tot een kunstzinnig object, een tastbaar iets. Helaas zijn de namen niet aanklikbaar, dus als blogroll heb je er niet veel aan.

Wil je de plaatjes beter bekijken, klik er dan op en kijk of je naam erbij staat.

Nu ik de blogroll bekijk, bedenk ik wel dat deze niet meer uptodate is. Veel mensen onderhouden hun Spoetnikblog niet meer. Aan de andere kant heb ik nu andere blogs leren kennen die èn actueel zijn èn op mijn interessegebied liggen. Daarom ga ik links van Spoetnik-blogs verwijderen, voorzover ze niet meer bijgehouden worden om ruimte te maken voor andere blogs/links.

Willen jullie me laten weten of:

  • je vindt dat ik je onterecht verwijderd heb (je gaat door met je blog)
  • of ik je misschien vergeten ben en je wel op mijn blogroll wilt staan?
  • of jij (of jouw bieb) misschien een andere blog bent begonnen? (geef dan de link)
  • of vertel hier even hoe het met je gaat, heb je ook een “after-spoetnik-dip”? of is het leven er alleen maar zonniger op geworden tijdens je vakantie en na de spoetnik-drukte?

Wil je zelf een WORDLE-plaatje maken, lees evt mijn vorige post (zie hier) of ga direct naar de Wordle-create pagina. Het wijst zich wel vanzelf en het is leuk (lees verslavend) om wat te experimenteren. Ik zag tussen 2 haakjes dat Bert op zijn nieuwe blog Zeemanspraat al een maand eerder een Wordle-wolk had gemaakt van een van zijn presentaties (zie hier)

Spoetnikblogs, UBA -en niet-UBA-deelnemers, vetgedrukt zij die (ooit) op mijn blogroll staan (stonden):

(Ja sorry niet overal de nr ervoor, ik had ze eerst verwijderd, maar om de verwijderde nummers achteraf weer toe te voegen???!! EEn karwei hoor, handmatig al die links toevoegen en http en wordpress.com verwijderen pfffffff)
UBA-deelnemers: 1. ubaspoetnik 2. spoetnik.mtb-schoorl.nl 3. astolfosullaluna 4. nielsmr 5. swealtsje ; robinvs ; swealtsje ; jaapdevisser ; afvalchinees ; jwdjoker. salamanc ; dexie ; moirac ; oefening40 ; lezen20. ; woutv ; nabaghlavi ; snavely ; donkeytail ; sperwer4 ; ijsbus ; ubsarah ; metgezel dorades ; zygomorf ; aristotalloss ; h1gh5 ; laikaspoetnik ; brughagedis ; averhag1; bidocblog ; pentagruel ; oktoberkind29 ; ubafranca ; duyfje ; sarabeemsterboer ; kramerotten ; plisu ; lynndelisa ; gildederspoetnikker ; margrieto ; filipsdestoute/ ; joeri25 ; geraldapm ; . criticus ; mammen ; annadv. ; creabea ; berendina. ; basler ; majomikl. ; acqvier ; overzichter ; gvulot ; gitele.; bibliobes ; athahualpa zanni3s ; mfeijen 59. mjdebooys. 60. timelost 61. jansenangeline 62. tillie 63. wmeijer1 64. googoes 65. epbintje 66. ubabert 67. sabineg49 68. hoorn 69. datinka. 70. wodunit 71. agje 72. boekenvlindertje 73. biciuvajamvw 75. rfernho 76. davehak 77. zwaandebbie 78. klokhuis 80. mar1jke 82. jeroenub1 83. snahamrof. 84. praagselente 85. herrie1 86. roosophetrokin. 87. 1forens. 88. grrootje 89. geantduprov 90. kaihenriquez 91. nancykleenex 92. aanbrand 93. turquoois 94. klijtberroo 95. hian46 96. technopcj 97. pussycat123 98. kate57 99. happymax100. lieuwekool 101. jbties 102. zichor 103. julietteolivier 104. staminalopodax 105. grensgebieden 106. snoever 107. guusroeloff 108. bknuppebv 109. ritagulinck 111. marcelsampimon. 112. iwoiwo 113. nikspoet 114. jeroenxx 115. debibliotheker 116. kladblogje 117. gazendam 118. elkedagwatanders 119. pimpampet 120. agnessavd 121. prbiebmiep 122. moniquekooijmans 123. schwitters 124. diederikmajoor 125. zonnetje4 126. redibis 127. yvonne18 128. loindesponts 129. raybeuker 130. martien128 131. trijnvanhamborg 132. truitje 133. mietjekopietje
Niet UBA-deelnemers
: 1. hollander68 2. wondersteen 3. hobbeltjes 4. ratafurell 5. tandory 6. no33.nl 7. evantee 8. peepastinakel 9. annajo 10. makok 11. gertiebastiaansen 12. ubautist 13. happinez 14. /wimam 15. maaikemo 16. calypta 17. gevleugeld 18. sotoha 19. xspainter 20. aagjedeboer 21. hoigagarin 22. rovingreports 23. bibliotheekheb 24. mariettevandepoll 25. chuqui9 26.leefsma 27. http://vooruitkijkengodelieveengbersen.blogspot.com 28. http://riamuisje.wordpress.com 29. http://pulpje.wordpress.com
74.

———————————–
Like to know what this is all about?? I’ve made a word cloud of the blogs of the online course SPOETNIK on NEW (web 2.0) internet communication methods for (dutch) librarians. First I made a cloud of the spoetnik blogs that were on my blogroll, then I made a cloud of all Spoetnikbloks including all cancelled ones (“opgeheven”).

However, I decided not to leave all Spoetnik blogs permanently on my blogroll for purely nostalgic reasons, but to remove those blogs that are poorly maintained or in a dormant state.
On the other hand I will soon add some blogs that I’ve been into lately, mostly on the field of medical librarianship, medicine and science.

If you’re interested in Wordle, you might take a look at my previous post on this subject or go directly to Wordle to create your own word-cloud.





Visualize your blog (words) with Wordle

3 08 2008

I just discovered Wordle through Thomas of “Biomedicine on Display” (blog of Medical Museion, University of Copenhagen), who wrote several posts on this new web toy. Thomas created a cloud of his own blog links, and of the World top blogs on Health and Medicine. I’m on these clouds, but couldn’t find my name. Can you? (it is weighted according to importance 😉 ).

Wordle is a free online Java ap created by Jonathan Feinberg, which generates word clouds from any given URL, RSS-feed, del.icio.us user names, or text you provide. The nice thing is you can tweak your clouds with different fonts, layouts (horizontal, vertical, random etc) and color schemes.

1. Laika’s URL – no english stopwords
2. Laika’s URL – no dutch stopwords

Above are two word-clouds of my blog, created by entering the URL of my blog and removing common words. However, since my blog is bilingual, removing English stop words leaves Dutch stop words and vice versa. Thus the two versions shown above most prominently show the stopwords of the other language, but that gives a funny effect. Wordle only shows the words of recent posts, those posts which show up when you type in the URL.
The variation is endless. Even when you refresh, you get a different picture.

Pictures can be saved online in the “the Gallery”.

3. Laika’s old category cloud – not weighted

Next I created a category cloud from my (old) categories (I need to update them). First I didn’t weight the words, entering each word once (3). But in the next series I gave the categories weight by repeating them as many times as they were used in my blog (4,5). I just show fig. 4, because ‘Social Networking’ was completely out of the cloud, which is -I think- a contradictio in terminis. Really amusing.

5. Category Cloud - weighted

Cat-cloud - weighted

4. Cat-cloud - weighted

Addison's disease info (nvacp)

6. Addison's disease info (NVACP)

Finally I copied the text from a Dutch Patient website (the NVACP) about Addison’s disease (which I have). This illustrate one of the applications of World: you can immediately grasp what the text is about. It can be used to visualize your presentation or even as an educational tool. (e.g. in this post Wordle is used to prepare a school lesson on the environment). But you can use Wordl for many purposes, i.e. make postcards, write a poem etcetera (see this post for some ideas).

Well anyway, playing with Wordle is great fun and a bit addicting.

Want to create your own: click here

——-

Een heel leuk nieuw web-speeltje: Wordle.
Toevallig leerde ik het kennen via Biomedicine on Display” (blog van het Medical Museion, Universiteit van Copenhagen), waar Thomas enkele berichten over deze applicatie plaatste.

Thomas maakte een woordwolk van zijn blogroll, en van de “Top Health and Medicine Blogs”. Ik sta ergens op deze wolkjes, maar heb ze nog niet kunnen localiseren. Nu ja wat wil je met meer dan 800 blogs, naar belang gerangschikt 😉

Wordle is een gratis Java applicatie, ontwikkeld door Jonathan Feinberg.
World genereert woordwolken vanuit een
URL, RSS-feed, del.icio.us gebruikersnaam of aangeleverde tekst. Het mooie eraan is dat je de wolken op verschillende manieren kunt opleuken. Je kunt heel veel verschillende lettertypen, lay-outs (verticaal horizontaal, kris-kras) en kleurenschema’s toepassen. Plaatjes kun je bewaren in “the Gallery”.

Ik heb eerst woordenwolken van mijn blog gemaakt door de URL in te voeren en de opdracht te geven stopwoorden te verwijderen. Maar mijn blog is twee-talig. Verwijder ik de nederlandse stopwoorden, dan komen juist de engelse stopwoorden prominent in beeld, en vice versa. Maar ach, dat is eigenlijk wel grappig. Wordle toont trouwens alleen een wolk van de laatste berichten, d.w.z. díe berichten die je ziet als je de url intypt. Bij mij gingen de laatste berichten juist over Twitter en PubMed.
Je kunt eindeloos varieren. En zelfs als je ‘refresht’ wordt het plaatje weer helemaal anders qua kleur-compositie.

Vervolgens maakte ik een wolk van mijn (oude) categoriën (althans het is het plan ze drastisch te vernieuwen, er komen nog teveel woorden van de Spoetnikcursus in voor die ik niet meer zal gebruiken). Eerst voerde ik de termen in enkelvoud in (3). Maar daarna gaf ik er gewicht aan door ze zo vaak te kopiëren als ze op mijn blog voorkomen (4,5). Fig 4 laat ik zien omdat ‘Social Networking’ er helemaal buitenhangt, eigenlijk een contradictio in terminis, maar wel amusant.

Addison's disease info (nvacp)

6. Addison's disease info (NVACP)

Tenslotte kopieerde ik tekst over de ziekte van Addison van de Nederlandse Vereniging van Addison en Cushingpatienten (NVACP). Dit illusteert meteen een van de mogelijkheden van Wordle: je ziet in een oogopslag waar de tekst over gaat. Daarom kun je met deze tool gebruiken je presentatie visualiseren, of het als een leermiddel inzetten (zie bijvoorbeeld dit bericht, waar Wordle is gebruikt voor een les over het milieu).

Maar je kunt Wordl op veel manieren toepassen, je kunt er bijvoorbeeld ansichtkaarten mee maken of een gedicht. (zie dit bericht voor enkele ideeen).

Nou, hoe dan ook, een beetje spelen met Wordle is erg leuk èn verslavend.

Wil je zelf aan de slag, klik dan hier!

Binnenkort meer…